Από ανασκαφικά ευρήματα προκύπτει ότι η πόλη των Χανίων είναι κτισμένη πάνω στα ερείπια της αρχαίας Κυδωνίας, την οποία κατά τη μυθολογία ίδρυσε ο Κύδων και αναφέρεται από τον Όμηρο. Ενδεικτικά αναφέρουμε την ακόλουθη αρχαιολογική θέση :

• Αρχαιολογική περιοχή Καστελίου (Κανεβάρο)