• Τα ακόλουθα είδη δέντρων: αλμυρίκια (Tamarix parviflora), κυπαρίσσια (Cupressus sepremvirens), διάφορα είδη ευκαλύπτων (Eucalyptus sp), λεύκες (Populus sp), πλατάνια (Platanus orientalis), ιτιές (Salix sp), συκιές (Ficus carica) και μουριές (Morus alba & nigra).
• Τα ακόλουθα είδη θάμνων: πικροδάφνες (Nerium oleader), λιγαριές (Vitex agnus-castus) και καλάμια (Arundo donax).
• Επίσης συναντώνται πολλά καλλωπιστικά φυτά, τα οποία έχουν προσαρμοσθεί στο τοπικό φυσικό περιβάλλον και να λειτουργούν ως αυτοφυή.

Στην Ζώνη ΙΙ (βόρειο / πεδινό τμήμα) τα δένδρα που κυριαρχούν είναι οι ελιές (Olea europea). Μαζί συναντώνται χαρουπιές (Ceratonia siliqua), όπως και αχλαδιές – αγριοαχλαδιές (Pyrus sp), κυπαρίσσια (Cupressus sepremvirens), πεύκα (Pinus brutia και halapensis εισαγόμενο είδος από την ηπειρωτική Ελλάδα), καρυδιές (Juglans regia), πλατάνια (Platanus orientalis), αμυγδαλιές (Prunus sp), σπάρτα (Spartium junseum), ασπάλαθοους (Calikotome vilosa), σκίνους (Pistacia lentiscus), πουρνάρια (Quercus coccifera). Τα περισσότερα από τα παραπάνω είδη απαιτούν ιδιαίτερες συνθήκες για να αναπτυχθούν.

Στην Ζώνη ΙΙΙ (ορεινή ημιορεινή), εκτός των δένδρων που αναφέρονται στην προηγούμενη ζώνη, συναντάμε επίσης την καστανιά (Castanea sativa), την κουμαριά (Arbutus unedo), τον αστείρακα (Styrax officinale), την αγριοκουμαριά (Arbutus adrachne), την Erica arborea, την Erica manipuliflora, την Euphorbia dendroides.
 

Περιγραφή παραλίας

Ο Δήμος Νέας Κυδωνιας είναι παραλιακός σε όλο το μήκος της βόρειας πλευράς του. Επειδή οι παραλίες του Δήμου ευρίσκονται στο βάθος του κόλπου των Χανίων, με ότι αυτό συνεπάγεται, είναι παραλίες με άμμο και ελάχιστα χαλίκια.